Uyum puanı nasıl hesaplanır?
Uyum puanı nasıl hesaplanır?

Video: Uyum puanı nasıl hesaplanır?

Video: Uyum puanı nasıl hesaplanır?
Video: Game Of Sultans- Uyum Nasıl Hesaplanır? 2024, Kasım
Anonim

NS Puan bir hizalama , S, hesaplanmış ikame ve boşluğun toplamı olarak puanlar . ikame puanlar bir arama tablosu ile verilmektedir (bkz. PAM, BLOSUM). Açıklık puanlar tipik olarak hesaplanmış G, boşluk açma cezası ve L, boşluk uzatma cezasının toplamı olarak. n uzunluğunda bir boşluk için, boşluk maliyeti G+Ln olacaktır.

Buna göre uyum puanı nedir?

En uygun hizalama ve hizalama puanı optimal hizalama bir hizalama en yüksek vermek Puan , ve hizalama puanı bu en yüksek mi Puan . yani, hizalama puanı X ve Y = Puan bir optimal altında X ve Y hizalama . Örneğin, hizalama puanı Aşağıdaki X ve Y'den 36'dır.

Yukarıdakilerin yanı sıra sıra hizalama nasıl çalışır? Biyoinformatikte, bir sıra hizalama düzenlemenin bir yoludur diziler arasındaki fonksiyonel, yapısal veya evrimsel ilişkilerin bir sonucu olabilecek benzerlik bölgelerini belirlemek için DNA, RNA veya protein diziler.

Bu arada, biyoinformatikte puan nedir?

Dizi hizalamaları bağlamında, bir Puan bir hizalamanın genel kalitesini tanımlayan sayısal bir değerdir. Daha yüksek sayılar daha yüksek benzerliğe karşılık gelir. NS Puan ölçek bağlıdır puanlama kullanılan sistem (ikame matrisi, boşluk cezası).

Sıra hizalamasında optimal hizalama nedir?

NS optimal hizalama iki protein diziler bu hizalama bu, eklenen boşluklar için herhangi bir ceza olmadan çift puanların toplamını en üst düzeye çıkarır. Dinamik programlama, optimal hizalama iki diziler m ve n'nin uzunlukları olduğu mn-adımlar sırasında bulunur. diziler.

Önerilen: